A látogató Paks és tágabb környékének történetével ismerkedhet meg, az őskortól a 19. század fordulójáig.

Az első helyiségben a település tágabb környékének őskori viszonyaiba pillanthatunk be a kelták megjelenésének korszakáig. A következő terem a Paks-Dunakömlőd Bottyán-sáncon már 1969 óta folyó régészeti ásatások leletanyagával, a római kori Pannonia Lussonium nevű katonai táborának történetét mutatja be.

Paks középkori története elválaszthatatlan a 14. században birtokot szerző, s nevét a településről kapó Paksy-családtól. Családfájuk és címerük mellett számos, a korszakhoz kapcsolódó tárgyi emlék látható.

A törökkor idején a település jelentős hadiút mentén helyezkedett el. E korszak építészeti emlékei jórészt nyomtalanul elpusztultak, így csak néhány dokumentum és tárgy fémjelzi a 150 éves török uralmat vidékünkön.

A Rákóczi-szabadságharc idején a dunakömlődi, egykori római katonai tábor területén emeltette fel Bottyán János generális a Dunántúlt védő, rövid életű palánkvárát.

A 18. század elejétől a település fejlődését elsősorban a kereskedelem és az ipar határozta meg. A céhes ipart felváltó ipartársulatok emlékei, a különböző felekezetek tárgyai mellett természetesen a halászat, illetve vízimalmok működtetése is jelentős szerepet játszott Paks gazdasági életében. Az ehhez kapcsolódó tárgyi emlékek és dokumentumok a két utolsó teremben láthatók.