A fényképek múzeumi elhelyezésének első gondolata 1862-ből származik. Veress Ferenc kolozsvári fényképész az Ország Tükre hasábjaink felhívást intéz az ország hivatásos fényképészeihez: "Fényképészeink nagy szolgálatot tehetnének honunknak azáltal, ha a tudomány, a művészet, az ipar és a kereskedelem mezején kitűnt kisebb-nagyobb nevezetes egyéneket levéve és összegyűjtve, albumalakban beadnánk a hazai múzeumokba. Én e gondolatot évek óta forgatom elmémben s létesítését az idén el is kezdem. Szándékom ugyanis... nevezetes egyéneket nemzet, vallás és nem különbség nélkül lefényképezni, kik szellemi és anyagi tehetségük(nél) fogva kitűntek, foglalkozzanak bár az irodalom, művészet, gazdászat és ipar mezején...

Másik nagy szolgálatot tehetné a hazai fényképészet a történelemnek úgy, ha minden régiséget, várakat, ó-kastélyokat, templomromokat, barlangokat, amik még fen vannak, de csak egy tized múlva is eltűnhetnek, fényképészetileg levenne, a jövő kornak hátra hagyva."

A gondolat csak töredékeiben realizálódik.

1990 decemberében megalakul a Magyar Fotográfiai Alapítvány. Kezdeményezői, fő támogatói az MFSZ-en kívül a FŐFOTÓ, a Fényképész Rt., a Művelődési és Közoktatási Minisztérium, a Reanal Finomvegyszergyár, a Forte, a Fuji Magyarország Kft., a Nikon Magyarország Kft..

1991. szeptember 13-án megtörténik a felújított épület műszaki átadása, decemberben pedig megnyitja kapuit a Magyar Fotográfiai Múzeum, Kincses Károly igazgató vezetésével.

A múzeum megnyitását követő évben az igazgató meghívására, igazgató-helyettesi munkakörbe került dr. Kolta Magdolna, aki a múzeum működtetésében és tudományos munkájában fejtette ki tevékenységét.

Kettejük munkájának eredményeképpen a múzeum alapításkori gyűjteménye megsokszorozódott, illetve elindult a gyűjtemény feldolgozása. Két könyvsorozat formájában jelentettek meg hiánypótló munkákat a magyar fotográfia témakörében. Közös tevékenységüknek dr. Kolta Magdolna halála vetett végett 2005. június 1-jén. Az ezt követő időszakban - 2006. január 1-től - a múzeum igazgatói tevékenységét Baki Péter végzi.