A Semmelweis Orvostörténeti Könyvtár 1951-ben jött létre az egykori budapesti irgalmas kórház 6000 kötetes régi könyvállományának átvételével. Gyarapodása során számos régi könyv gyűjtemény került részben vagy egészben a Könyvtár birtokába. A Könyvtár 1900-ig gyűjti az egyetemes és magyar orvosi és gyógyszerészeti irodalom anyagát. A történeti feldolgozáshoz szükséges művek, segéd- és kézikönyvek gyűjtése időhatár nélkül történik. A könyvtár jelenlegi állománya mintegy 120.000 kötet, ebből cca. 80.000 kötet könyv, 20.000 kötet folyóirat, 10.000 orvosi disszertáció, 10.000 különlenyomat.

A legértékesebb műveket, mintegy 1200 kötetet, külön gyűjteményként kezeljük. E külön gyűjteményben találhatóak a kéziratok, ősnyomatok, a XVI. századi nyomtatványok, régi magyar könyvek (1800-ig), valamint a XVII- XVIII. század kiemelkedő értékű kiadványai és jelentősebb magyar orvos műveinek első kiadásai.

A könyvtár könyv- és különlenyomat anyagának elektronikus feldolgozása már évek óta folyik, jelenleg a könyvtár könyvanyaga és történeti különlenyomat-gyűjteménye hozzáférhető az Interneten is.

A Semmelweis Orvostörténeti Könyvtár nemcsak Magyarországon, hanem egész Kelet-Európában az egyetlen olyan gyűjtemény, amelyben orvos- és egészségügy-történeti, gyógyszerészettörténeti témák eredménnyel kutathatók.